Multi-Frequenz-ESR spinmarkierter Proteine

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https://osnadocs.ub.uni-osnabrueck.de/handle/urn:nbn:de:gbv:700-2012120610506
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Title: Multi-Frequenz-ESR spinmarkierter Proteine
Authors: Urban, Leszek
Thesis advisor: Prof. Dr. Heinz-Jürgen Steinhoff
Thesis referee: Prof. Dr. Sebastian Schlücker
Abstract: Die Elektronen-Spin-Resonanz-Spektroskopie (ESR) in Verbindung mit ortsspezifischer Spinmarkierung stellt eine hervorragende Möglichkeit dar, um die Struktur und Dynamik von Proteinen aufzuklären. In dieser Dissertation wurden mit Hilfe der Hochfeld-ESR-Spektroskopie (W-Band, 95 GHz, T=160 K) für dreizehn spinmarkierte Colicin A Proben die Polarität und die Protizität der Umgebung der Spinlabelbindestelle bestimmt. Wasserzugänglichkeiten und Wasserstoffbrückenbindungen zum Spinlabel wurden mittels Puls-ESR Methoden (3-Puls-D-ESEEM und Hahn-Echozerfall) bestimmt und die Ergebnisse mit den Polaritäts- und Protizitätswerten korreliert. Raumtemperaturspektren dieser Proben im X-Band (9.5 GHz), Q-Band (34 GHz) und W-Band (95 GHz) liefern Informationen über die Spinlabelbewegung. Mit Hilfe von Molekulardynamiksimulationen (MD) der spinmarkierten kanalbildenden Domäne von Colicin A konnten die Konformationen (Rotameranalyse) und die Dynamik der Spinlabelseitenketten in den unterschiedlichen Umgebungen charakterisiert werden. Der Vergleich der experimentellen mit den aus MD-Trajektorien berechneten ESR-Spektren liefert die Beiträge der unterschiedlichen Rotamerübergänge, die für die beobachteten Spektrenformen charakteristisch sind.
URL: https://repositorium.ub.uni-osnabrueck.de/handle/urn:nbn:de:gbv:700-2012120610506
Subject Keywords: ESR; Elektronen-Spin-Resonanz-Spektroskopie; Spektroskopie; SDSL; ortsspezifische Spinmarkierung; Protein; Makromolekül; Colicin A; MD-Simulation; Molekulardynamik; Computersimulation; Rotamer; Multi-Frequenz-ESR; X-Band; Q-Band; W-Band; Puls-ESR; cw-ESR; ESEEM; Echo; Echozerfall; Hahn-Echo; R1; MTSSL; Methanethiosulfonat-Spinlabel; Polarität; Protizität; Wasserzugänglichkeit; Wasserstoffbrückenbindungen; H-Brücken; Rotameranalyse; Spektrenberechnung; SRLS; MOMD; Hyperfeinkopplung; g-Tensor; Hochfeld-ESR
Issue Date: 6-Dec-2012
License name: Namensnennung-NichtKommerziell-KeineBearbeitung 3.0 Unported
License url: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/
Type of publication: Dissertation oder Habilitation [doctoralThesis]
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