osnaDocs: ESR-Spektroskopie kombiniert mit weiteren theoretischen und experimentellen Methoden der Biophysik: ESR-Spektrensimulation an Bakteriorhodopsin, Temperatursprung-ESR an Reverser Transkriptase

ESR-Spektroskopie kombiniert mit weiteren theoretischen und experimentellen Methoden der Biophysik: ESR-Spektrensimulation an Bakteriorhodopsin, Temperatursprung-ESR an Reverser Transkriptase

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https://osnadocs.ub.uni-osnabrueck.de/handle/urn:nbn:de:gbv:700-2008101023

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DC Element	Wert	Sprache
dc.contributor.advisor	Prof. Dr. Heinz-Juergen Steinhoff
dc.creator	Beier, Christian
dc.date.accessioned	2010-01-30T14:37:04Z
dc.date.available	2010-01-30T14:37:04Z
dc.date.issued	2008-10-09T15:55:57Z
dc.date.submitted	2008-10-09T15:55:57Z
dc.identifier.uri	https://osnadocs.ub.uni-osnabrueck.de/handle/urn:nbn:de:gbv:700-2008101023	-
dc.description.abstract	Diese Dissertation befaßt sich mit kinetischen und dynamischen Analysen an spinmarkierten Proteinen mittels Elektronenspinresonanz-Spektroskopie (ESR-S) in Kombination mit weiteren biophysikalischen Methoden. Die Spinmarkierung der hier untersuchten Proteine (z.B. Bakteriorhodopsin (EF-loop) bzw. Reverse Transkriptase) erfolgt durch spezifische Substitution ausgewählter Aminosäure-Seitenketten durch eine radikalische Seitenkette ("R1", MTS-Spinlabel an Cystein gebunden). Der Schwerpunkt dieser Arbeit liegt in der Methodenentwicklung eines neuen Simulationsverfahrens für ESR-Spektren basierend auf einer speziellen Molekulardynamik-Simulation (MD-S). Das Verfahren nutzt den von Robinson et al. (J.Chem.Phys.96:2609-2616) vorgeschlagenen Trajektorien-basierten Berechnungsalgorithmus für ESR-Spektren. Hierfür sind zahlreiche Trajektorien der umgebungsabhängigen Umorientierungsdynamik von R1 mit Längen von jeweils über 700 ns erforderlich. Diese Trajektorien werden im hier präsentierten Simulationsverfahren mit minimalem Zeitaufwand in drei Stufen generiert: i) statistisch korrekte Erfassung des gesamten verfügbaren Konformationsraums von R1 in positionsspezifischer Proteinumgebung mittels einer kurzen (ca. 10 ns) speziellen MD-S (in-vacuo, 600 Kelvin); ii) Berechnung eines Potentials im Eulerwinkelraum welches das spezifische Umorientierungsverhalten der radikalischen R1-Kopfgruppe widerspiegelt; iii) Trajektorienberechnung mittels Simulation der potentialabhängigen Brownschen Umorientierungsdynamik eines virtuellen Teilchens bei 300 Kelvin (Einteilchen-Simulation). Die Statistiken wichtiger dynamischer Prozesse während der speziellen MD-S werden analysiert und mit Langzeit-Dynamiken aus herkömmlichen MD-S unter physiologischen Bedingungen verglichen. Zusätzlich wird ein Simulationsverfahren zur Identifikation von Wasserstoff-Brücken vorgestellt. In einem weiteren Kapitel dieser Arbeit werden Konzeption, Aufbau und Test einer Temperatursprung-ESR-Anlage beschrieben.	ger
dc.language.iso	ger
dc.subject	R1-Mobilität
dc.subject	Langzeit-Umorientierungstrajektorien
dc.subject	Distance-Theta-Lambda-System
dc.subject	DTL-Parameter
dc.subject	Hochspannungsentladung über Schwingkreis
dc.subject.ddc	570 - Biowissenschaften, Biologie	ger
dc.title	ESR-Spektroskopie kombiniert mit weiteren theoretischen und experimentellen Methoden der Biophysik: ESR-Spektrensimulation an Bakteriorhodopsin, Temperatursprung-ESR an Reverser Transkriptase	ger
dc.title.alternative	EPR-Spectroscopy in combination with additional theoretical and experimental biophysical methods: EPR spectra simulation on Bacteriorhodopsin, Temperature-jump EPR on Reverse Transcriptase	eng
dc.type	Dissertation oder Habilitation [doctoralThesis]	-
thesis.location	Osnabrück	-
thesis.institution	Universität	-
thesis.type	Dissertation [thesis.doctoral]	-
thesis.date	2008-09-15T12:00:00Z	-
elib.elibid	832	-
elib.marc.edt	jost	-
elib.dct.accessRights	a	-
elib.dct.created	2008-10-08T01:58:34Z	-
elib.dct.modified	2008-10-09T15:55:57Z	-
dc.contributor.referee	Prof. Dr. Manfred Neumann
dc.subject.bk	33.07 - Spektroskopie	ger
dc.subject.bk	42.12 - Biophysik	ger
dc.subject.bk	54.76 - Computersimulation	ger
dc.subject.dnb	29 - Physik, Astronomie	ger
dc.subject.dnb	32 - Biologie	ger
vCard.ORG	FB4	ger
Enthalten in den Sammlungen:	FB06 - E-Dissertationen

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E-Diss832_thesis.pdf	Präsentationsformat	22,63 MB	Adobe PDF	E-Diss832_thesis.pdf Öffnen/Anzeigen

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